Скачиваем mkvtoolnix для своей платформы. Нажимаем "add" и указываем полный путь к файлу *mkv и файлу озвучке.
В окне программы появляется все возможности *mkv - разделение на временные разделы фильма и все звуковые дорожки. Отмечаем чекбоском только то, что нам необходимо. В моем случае это сам видео файл, разделы и нужная мне озвучка, с остального снимаю. Внимательно указываю путь к финальному файлу и нажимаю "Start muxing".
В моем случае весь процесс занял 5 минут. Если бы указал финальный путь на Time Capsule, времени бы ушло чуть больше.
Ваш КО.